请教EC10,EC20的算法

该主题包含 5 条回复,5个帖子,最后由  winter1213 月 之前 更新。

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  • 1 楼

    fanxing518
    Participant

    大家好,我现在作一个药物浓度与生物活性关系的实验,
    得到一组数据,但实验设计要求得出EC10,EC20这样的值,很多地方都只介绍EC50的计算,没有说其它的算法,请问这样的值应该如何算出来呢?用什么软件?大体步骤怎么作呢?
    多谢!!

    2 楼

    biostat
    Participant

    与EC50的计算原理是一样的

    3 楼

    doctorjxd
    Participant

    关于计算剂量-反应关系,特别推荐R的”drc”包(需要安装),LD50, ED50,IC50等等,而且都是经典方法,帮助里面有参考文献的。(特别是LD50的Finney,是FDA推荐的)

    计算EC10、EC20等及其可信限、标准差,可以用里面的ED函数。很方便的。

    4 楼

    叶子1987
    Participant

    LC即lethal concentration,即引起试验动物死亡的毒物浓度。表示致死浓度时,常在C的下方写上一具体数字,以表示引起该死亡百分数的浓度,LC50即指引起50%试验动物死亡时的毒物浓度。

    当试验不以死亡作为试验生物对毒物的反应指标,而是观察测定毒物对生物的某一影响,如藻类生长受抑制,常用有效浓度即EC(effective concentration)来表示毒物对试验生物的毒性。EC50即指半数有效浓度,是指引起50%试验动物产生某一特定反应,或是某反应指标被抑制一半时的浓度。

    可用SAS的PROBIT过程分析得到

    具体算法见《药物评价实验设计与统计学基础》P31

    5 楼

    doctorjxd
    Participant

    《药物评价实验设计与统计学基础》P31 所介绍的算法过于简化,仅仅是大概的理解,具体算法是不准确的。而且不能处理概率是0或100%的情况。

    现代probit回归,不是这么简单计算的,只能通过非线性最小二乘法或最大似然法逐步迭代逼近,具体见Finney的《Probit Analysis》。

    所以实际应用时,可以采用楼上建议的SAS里面的 PROCEDURE Probit(看SAS手册,这个算法引用了Finney的《Probit Analysis》里面的从Bliss发展而来的算法),SPSS的命令行手册也有Probit过程,同样引用了Finney的经典文献。

    R的drc包也是同样引用了同样的Finney的经典文献。

    6 楼

    winter121
    Participant

    回复 5 楼doctorjxd
    您好!那根据您说的应该用什么软件来算EC10呢?求推荐 谢谢

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