• R语言

  • R语言的执行效率问题

我有120000行数据，用perl写成12万行R命令做t.test，然后执行，大概几分钟就算完了。

如果只用R语言，把所有数据先读入，然后用循环，每一行做t.test，花了几个小时，到现在还没有算完。

这说明一个问题，在R里执行单行命令要比用循环快，涉及到循环的问题，最好写成单行命令执行。
矩阵比数据框快

按列读取比按行读取快
R的一个优势就是矩阵运算，不要用循环亵渎了……
我也遇到一样的问题啊，运算1个小时，好头痛哦！！！[s:15]



[quote]引用第1楼jah_et于2009-12-12 11:42发表的  :

有apply吧...

[/quote]



请问apply 可以运行循环计算吗？



[quote]引用第2楼qxde01于2009-12-12 11:59发表的  :

矩阵比数据框快

按列读取比按行读取快

[/quote]



原来是这样啊？！



[quote]引用第3楼鱼蛋于2009-12-12 17:12发表的  :

R的一个优势就是矩阵运算，不要用循环亵渎了……

[/quote]



矩阵可以解决循环计算的问题吗？
如果你的循环比较有规律，比如是针对矩阵的行或列做运算，那么大都可以用apply()系列的函数来实现。
[quote]引用第6楼谢益辉于2009-12-14 16:55发表的  :

简单在主站写了写：http://cos.name/2009/12/improve-r-computation-efficiency/

[/quote]



刚看完谢老师的文章，原来Apply也可以这么用的。虽然不完全明白，但是学生会继续学习~ ^_^

(谢老师连节省的时间都计算出来直接对比，好佩服哇！！！)